作為生物質的重要組成,淀粉是植物通過光合作用將太陽能轉化為化學能后的能量載體。
隨著合成生物學與生物催化技術發展,科研人員已實現以“一碳化合物”為原料的人工淀粉創制。Amylomaltases(AM)是淀粉修飾的關鍵酶,可通過獨特的環化特征調控淀粉生化特性,形成α-1,4-糖苷連接的大環多糖(CA)。CA工業應用快速發展,但AM環化過程機制的復雜性,以及轉糖苷酶家族中轉糖基化與水解的相互作用仍然未知,制約了該生物質利用關鍵酶的智能塑造和性能提升。
近日,中國科學院天津工業生物技術研究所與亞熱帶農業生態研究所合作,在淀粉修飾研究方面取得進展。研究團隊利用大規模分子模擬、二維自由能計算、QM/MM量化計算,以原子分辨率揭示AM共價和非共價的完整催化循環,確定了CA合成的決速步驟。在生化實驗中,團隊通過策略性調節多糖鏈轉移步驟,獲得多個活性增強的突變體。酶促動力學結果表明,酶性能提升源于底物轉移途徑中酶與底物的親和力下降,從而加快糖鏈在AM表面的轉移,促進環化過程。
進一步,團隊利用Mass spectrometry檢測發現,在AM催化多糖底物后,生成聚合度范圍為22至61的CA,證實了理論計算推測。團隊同時探討AM中轉糖基化和水解關系這一問題,量化了二者之間的動力學競爭平衡,為設計具有更高效率和特異性的轉糖苷酶提供了機制見解。
這一工作從工業性能角度,對CA生物合成過程進行分子水平研究,為AM家族提供了工程藍圖。
相關研究成果發表在《美國化學會志》(JACS)上。研究工作得到中國科學院戰略性先導科技專項等的支持。
論文鏈接
AM轉糖基化反應QM/MM計算示意圖
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