3月19日，記者從中國科學院海洋研究所了解到，該所研究團隊在國際上首次發布了銀鯧的高質量染色體水平參考基因組。相關研究論文近日在線發表于《自然》子刊《科學數據》。
銀鯧廣泛分布于西北太平洋近岸海域，肉質細膩，油脂豐富，是我國重要的經濟魚類。近年來，由于過度捕撈，野生銀鯧資源急劇衰退。我國銀鯧人工繁育與養殖技術雖取得突破性進展，但銀鯧對環境變化極為敏感，在運輸和養殖過程中容易發生應激死亡，這大大制約了銀鯧養殖產業的發展。
在前期研究的基礎上，中國科學院海洋研究所劉靜研究團隊綜合采用二代、三代高通量測序技術以及染色體構象捕獲技術，對銀鯧基因組進行了深度測序和組裝，在國際上首次獲得了銀鯧的高質量染色體水平參考基因組，得到銀鯧24條染色體單體序列。研究精確揭示了銀鯧基因組大小為5.1806億個堿基，指示基因完整度的兩個指標——Contig N50和Scaffold N50長度均達兩千萬堿基級別，這表明該基因組完整度極高，達到染色體級別。最終，研究人員獲得了24696個蛋白編碼基因，通用單拷貝直系同源基因基準數據集的評估值高達98.90%。
該研究成果為深入解析銀鯧食道側囊和腹鰭缺失性狀演化、種質遺傳資源評估、抗逆品種選育及銀鯧漁業資源可持續利用等研究提供了高質量參考基因組基礎。
3月19日，記者從中國科學院海洋研究所了解到，該所研究團隊在國際上首次發布了銀鯧的高質量染色體水平參考基因組。相關研究論文近日在線發表于《自然》子刊《科學數據》。
銀鯧廣泛分布于西北太平洋近岸海域，肉質細膩，油脂豐富，是我國重要的經濟魚類。近年來，由于過度捕撈，野生銀鯧資源急劇衰退。我國銀鯧人工繁育與養殖技術雖取得突破性進展，但銀鯧對環境變化極為敏感，在運輸和養殖過程中容易發生應激死亡，這大大制約了銀鯧養殖產業的發展。
在前期研究的基礎上，中國科學院海洋研究所劉靜研究團隊綜合采用二代、三代高通量測序技術以及染色體構象捕獲技術，對銀鯧基因組進行了深度測序和組裝，在國際上首次獲得了銀鯧的高質量染色體水平參考基因組，得到銀鯧24條染色體單體序列。研究精確揭示了銀鯧基因組大小為5.1806億個堿基，指示基因完整度的兩個指標——Contig N50和Scaffold N50長度均達兩千萬堿基級別，這表明該基因組完整度極高，達到染色體級別。最終，研究人員獲得了24696個蛋白編碼基因，通用單拷貝直系同源基因基準數據集的評估值高達98.90%。
該研究成果為深入解析銀鯧食道側囊和腹鰭缺失性狀演化、種質遺傳資源評估、抗逆品種選育及銀鯧漁業資源可持續利用等研究提供了高質量參考基因組基礎。
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