房間隔缺損修補術后可能出現后遺癥，但多數患者術后恢復良好。后遺癥的發生與缺損大小、手術方式、個體差異等因素相關，常見表現包括心律失常、殘余分流、血栓栓塞等。
心律失常是術后較常見的后遺癥，可能與心臟傳導系統在術中受到牽拉或損傷有關。殘余分流指修補部位存在微小縫隙導致血液異常流動，多發生于缺損較大或采用介入封堵術的患者。血栓栓塞風險與術后血液流動改變相關，需長期抗凝治療預防。部分患者可能出現心功能不全，尤其是術前已存在肺動脈高壓者。術后感染如心內膜炎雖罕見，但需警惕發熱等感染征象。
少數患者可能發生封堵器脫落或移位，多見于介入術后早期。心臟穿孔是罕見但嚴重的并發癥，需緊急處理。術后遠期可能出現瓣膜功能異常，與缺損鄰近瓣膜結構相關。個別患者對封堵材料產生過敏反應，表現為局部炎癥或全身癥狀。兒童患者術后可能面臨胸廓發育異常，與手術入路選擇有關。
房間隔缺損修補術后應定期復查心臟超聲和心電圖，術后3個月內避免劇烈運動。保持低鹽飲食有助于減輕心臟負荷，戒煙限酒可降低心血管風險。出現心悸、氣促、下肢水腫等癥狀需及時就診。嚴格遵醫囑服用抗凝或抗心律失常藥物，不可自行調整劑量。保持良好的口腔衛生可預防感染性心內膜炎。
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