直腸神經內分泌腫瘤的嚴重程度與腫瘤大小、分化程度及是否轉移有關，多數早期局限性腫瘤預后較好，但侵襲性或轉移性病例需積極干預。
體積較小且分化良好的直腸神經內分泌腫瘤通常生長緩慢，惡性程度較低。這類腫瘤直徑多小于2厘米，局限于黏膜或黏膜下層，內鏡下切除后5年生存率較高。患者可能僅表現為排便習慣改變或偶發便血，部分病例甚至無典型癥狀，通過腸鏡檢查偶然發現。病理分級為G1級的腫瘤細胞增殖指數低，Ki-67指數通常小于3%，此類情況定期隨訪即可。
當腫瘤直徑超過2厘米、浸潤肌層或出現脈管侵犯時，臨床風險顯著增加。病理分級G2-G3的腫瘤Ki-67指數超過3%，具有較強侵襲性，可能發生區域淋巴結或遠處轉移。患者可能出現腸梗阻、持續腹痛、體重下降等進展期癥狀。約20%的病例確診時已存在轉移，常見轉移部位包括肝臟和骨骼，此時需結合手術、靶向治療及生長抑素類似物等多學科綜合治療。
建議確診后通過超聲內鏡、CT/MRI等完善分期評估，根據腫瘤分級分期制定個體化方案。日常需注意觀察排便性狀變化，避免辛辣刺激飲食，每3-6個月復查腫瘤標志物和影像學檢查。若出現新發腹痛、黃疸或骨痛等癥狀應及時就診。
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