垂體神經內分泌腫瘤是常見的顱內腫瘤之一，包含多種激素分泌細胞類型，且臨床表現多樣。當前的病理分類系統主要依賴轉錄因子的表達和激素染色來區分三大垂體瘤譜系，無法充分捕捉各腫瘤譜系內部亞型的異質性。因此，亟需精確識別垂體瘤的分子特征并進行更詳細的亞型分類，以提升臨床診斷準確性、各個亞型發病機制的認知和治療效果。相比于整體基因表達，基因的可變剪接特征在數量上更為豐富，可以提供轉錄本結構和功能多樣性的額外信息。同時，剪接失調已被證實在多種人類腫瘤中可以促進腫瘤的發生發展。然而，垂體瘤中可變剪接的整體景觀及其衍生的腫瘤異質性尚未得到充分研究。
2月11日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）劉肇祺團隊，聯合北京天壇醫院（北京市神經外科研究所）謝微嫣與李儲忠團隊，在《自然-通訊》（Nature Communications）上在線發表了題為Splicing diversity enhances the molecular classification of pituitary neuroendocrine tumors的研究論文。該研究基于剪接功能紊亂介導的轉錄特征多樣性，深度刻畫了垂體瘤各亞型的異質性，提供了較為全面的垂體瘤各譜系癌種的剪接失調圖譜。
該研究利用剪接特征揭示了各個垂體瘤譜系內部的癌種異質性，發現了剪接缺陷與剪接因子表達異常之間的調控模式。這些結果在獨立的垂體腫瘤隊列中得到了驗證。進一步，研究在單細胞水平上證實了上述發現，并細化了不同垂體癌細胞克隆存在的剪接失調模式。
進一步，該研究開發了一組剪接特征標記，可將垂體瘤TPIT譜系細分為功能型和沉默型ACTH亞組。這種剪接失調衍生的瘤內異質性難以在傳統病理診斷中檢測到。基于這些亞型特異性的剪接特征，研究在TPIT譜系的沉默型ACTH亞組中定義了一種新亞型。該亞型主要與剪接因子ESRP1的表達下調相關，且具有較差的臨床預后。
上述研究鑒定了垂體瘤各亞型特異的剪接失調特征，提升了科學家對垂體瘤精準診斷的生物學理解，強調了剪接功能紊亂在刻畫垂體瘤異質性中的重要作用。整合這些剪接特征將有助于指導不同垂體瘤亞型的臨床分類和治療策略，并有望為未來的診療研究提供新方向。
研究工作得到國家自然科學基金、北京市自然科學基金等的支持。
論文鏈接
垂體瘤全譜系癌種的可變剪接分析流程概覽
本文鏈接：垂體瘤剪接功能異質性獲揭示http://www.sq15.cn/show-12-718-0.html
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