中國科學(xué)院生物物理研究所徐平勇研究組在在內(nèi)源蛋白標記上取得突破,開發(fā)了普適性強的內(nèi)源蛋白標記技術(shù)ANGEL,突破性地解決了無熒光小肽基因敲入時無法進行高通量篩選的瓶頸。相關(guān)論文8月29日發(fā)表于《自然-化學(xué)生物學(xué)》。
人類基因組包含約2萬個蛋白質(zhì)編碼基因,經(jīng)過可變剪接和翻譯后修飾可形成上百萬種蛋白質(zhì)變體。深入理解這些蛋白質(zhì)的定位、表達和相互作用,需要準確的內(nèi)源水平研究。目前,常見的通過融合熒光基因過表達的方法存在明顯局限。
納米抗體因體積極小、穩(wěn)定性高、親和力強而廣泛應(yīng)用。研究人員注意到,ALFA標簽是一種僅含13個氨基酸、結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的小標簽,可與特異性納米抗體NbALFA結(jié)合。更重要的是,NbALFA的穩(wěn)定性取決于ALFA標簽的存在:在標簽缺失時易被降解,而在標簽存在時熒光信號增強。
基于這一特性,研究團隊提出了“抗原穩(wěn)定抗體”概念,并通過定向進化獲得新型突變體mutNbALFA。該突變體在無標簽時迅速降解,而在標簽存在時釋放強熒光信號,由此實現(xiàn)了對小肽基因敲入克隆的高效識別。團隊進一步建立了穩(wěn)定表達NbALFA-熒光融合蛋白的細胞系,結(jié)合CRISPR技術(shù),將ALFA標簽精準敲入目標基因,從而通過熒光變化直接篩選成功編輯的細胞。
這一創(chuàng)新技術(shù)被命名為ANGEL(ALFA Nanobody-guided endogenous labeling)。研究表明,ANGEL能夠高效標記多種內(nèi)源蛋白,并具備向其他小肽標簽拓展的潛力。它為內(nèi)源蛋白功能研究提供了便捷可靠的“一站式”工具,克服了傳統(tǒng)過表達方法的局限,有望在蛋白質(zhì)動態(tài)調(diào)控研究和藥物開發(fā)中發(fā)揮重要作用。
該工作受到國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金以及中國科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項等項目的資助。
相關(guān)論文信息:
https://www.nature.com/articles/s41589-025-02019-7
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