近日,中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院彭廣敦研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)出新型單細(xì)胞譜系示蹤技術(shù)(DuTracer)。這一技術(shù)通過巧妙結(jié)合CRISPR-Cas9和Cas12a兩種基因編輯工具,提升了細(xì)胞譜系追蹤的精度和深度,為解析胚胎發(fā)育、器官再生和疾病機(jī)制提供了新工具。相關(guān)研究成果發(fā)表在《細(xì)胞報(bào)告》(Cell Reports)上。
生物學(xué)中,細(xì)胞譜系示蹤類似于繪制細(xì)胞家族樹,來追溯細(xì)胞從起源到分化的完整歷程。傳統(tǒng)方法因技術(shù)限制致使信息記錄不全,而基于CRISPR的基因編輯技術(shù)提高了分辨率,卻存在靶點(diǎn)間大片段刪除難題,如同在記錄家族歷史時(shí)丟失關(guān)鍵代際信息。 ?
DuTracer的創(chuàng)新之處在于同時(shí)利用Cas9和Cas12a兩種核酸酶,并通過控制它們的激活時(shí)間,避免多靶點(diǎn)同時(shí)編輯引發(fā)的干擾。實(shí)驗(yàn)顯示,該技術(shù)在小鼠胚胎干細(xì)胞和類器官模型中降低了90%以上的有害刪除事件,且記錄的細(xì)胞分裂層級更深,能夠更精準(zhǔn)地還原細(xì)胞分化路徑。
該研究在HEK293T細(xì)胞和小鼠胚胎類器官中驗(yàn)證了DuTracer的性能。結(jié)果顯示,該技術(shù)能夠清晰區(qū)分心臟細(xì)胞的不同起源如第一心域和第二心域,并可以揭示神經(jīng)中胚層前體細(xì)胞的分化偏好性。
DuTracer為單細(xì)胞水平的譜系追蹤設(shè)立了新標(biāo)準(zhǔn)。同時(shí),這一技術(shù)適用于胚胎發(fā)育研究,并有望用于解析癌癥轉(zhuǎn)移、器官再生等復(fù)雜過程。
研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和國家自然科學(xué)基金等的支持。
論文鏈接
DuTracer設(shè)計(jì)及其在類器官中的應(yīng)用示意圖
本文鏈接:新型單細(xì)胞譜系追蹤技術(shù)問世http://www.sq15.cn/show-12-708-0.html
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