節肢動物是地球種類最豐富的動物類群，包括昆蟲、甲殼類動物、鱟、蝎子、蜘蛛等。NALDVs是一類以桿狀病毒為代表的主要感染節肢動物的大DNA病毒。已有研究表明，NALDVs可在宿主基因組中發生廣泛整合并形成非逆轉錄內源性病毒元件。目前，科研人員尚未在蜘蛛中發現相關病毒或非逆轉錄內源性病毒元件。
近日，中國科學院武漢病毒研究所研究員王曼麗和胡志紅團隊利用蛋白質結構預測與同源搜索等創新方法，在蜘蛛基因組中發現了一類廣泛存在且源自NALDV的非逆轉錄內源性病毒元件。這一發現拓展了學界對節肢動物中NALDV分布和進化歷史的認識。
???該研究利用桿狀病毒蛋白結構比對和同源搜索，在已測序的幾乎所有蜘蛛物種基因組中發現了一類此前未被識別的非逆轉錄內源性病毒元件。系統發育樹分析顯示，這類非逆轉錄內源性病毒元件代表了全新的NALDV類群。進一步，研究通過分析蜘蛛轉錄組數據和小RNA測序數據發現，這些非逆轉錄內源性病毒元件能夠產生mRNA、siRNA及piRNA，并在蜘蛛絲腺中表現出特異性表達。進化分析顯示，這些非逆轉錄內源性病毒元件的共同祖先出現于距今3億多年前的古生代。
這一研究揭示了蜘蛛中非逆轉錄內源性病毒元件的存在及其相關轉錄活性，豐富了學界對NALDVs分布與進化的理解，為深入探討蜘蛛絲腺生物學功能及其演化過程提供了新的視角。同時，該研究展示了蛋白質結構預測和同源搜索等技術手段在病毒分類與內源性病毒挖掘中的潛力。
相關研究成果以Discovery of novel non-retroviral endogenous viral elements reveals their long-term integration history in spiders為題，發表在《自然-通訊》（Nature Communications）上。研究工作得到國家自然科學基金委員會的支持。
論文鏈接
蜘蛛基因組中豐富的非逆轉錄內源性病毒元件
本文鏈接：科研人員在蜘蛛中發現大量新型內源性病毒http://www.sq15.cn/show-12-1438-0.html
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