動態解析基因組轉錄調控是解讀細胞命運和疾病發生機制的關鍵。然而，傳統RNA測序技術受限于高豐度穩態RNA，難以捕捉轉錄活動的即時變化。近年來，新生RNA測序技術成為實時監測轉錄動態的關鍵工具。相較于傳統RNA測序技術，新生RNA測序技術可從新生RNA即時表達情況、轉錄暫停情況及非編碼轉錄調控元件的活躍情況三個層面提供轉錄調控信息。
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員鮑習琛團隊收集并整理了涵蓋22個物種、415項研究的3664個新生RNA測序數據集，構建了綜合性的新生RNA數據庫NaRaDa，并提供樣本質控信息，以確保用戶可篩選高質量數據集。進一步，NaRaDa鑒定了558574個來自不同物種的轉錄調控元件，用戶可通過感興趣的基因來探索，也可通過篩選具有特定處理或實驗條件的項目來獲取其對應調控元件。同時，NaRaDa支持用戶在線分析不同新生RNA數據集的轉錄調控變化，包括新生RNA表達差異、RNA聚合酶的暫停/釋放轉變以及轉錄調控元件的活躍程度變化。用戶可下載并利用上述信息，深入剖析基因和調控元件在各種情況下的轉錄動力學。
該研究構建了綜合性的新生RNA數據庫，為解析轉錄起始變化、RNA代謝動力學及基因調控網絡提供了資源庫。
相關研究成果以NaRaDa: A comprehensive nascent RNA database為題，發表在The Innovation Life上。研究工作得到國家自然科學基金委員會、科學技術部等的支持。
論文鏈接
NaRaDa的整體框架
本文鏈接：研究構建綜合性的新生RNA數據庫http://www.sq15.cn/show-12-1461-0.html
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