蛋白質代謝是機體分解與合成蛋白質的動態過程，包括蛋白質分解為氨基酸、氨基酸的轉化與利用、以及新蛋白質的合成三個階段。
蛋白質代謝始于胃腸道的消化階段。食物中的蛋白質在胃酸和胃蛋白酶作用下初步分解，進入小腸后被胰蛋白酶、糜蛋白酶等進一步水解為短肽和游離氨基酸。這些產物通過腸黏膜細胞吸收進入血液，經門靜脈運輸至肝臟。肝臟對氨基酸進行脫氨基處理，產生的氨轉化為尿素排出體外，碳骨架則參與三羧酸循環供能或轉化為葡萄糖、脂肪。
氨基酸在細胞內通過轉氨基作用重新組合，形成機體所需的各種蛋白質。這一過程依賴核糖體、轉運RNA和信使RNA的協同作用，按照DNA編碼指令合成特定蛋白質。多余的氨基酸可通過糖異生途徑生成葡萄糖，或轉化為酮體作為備用能源。肌肉組織中的蛋白質在禁食狀態下會分解為支鏈氨基酸，為重要器官提供能量基質。
蛋白質代謝受多種激素調節。胰島素促進氨基酸攝取和蛋白質合成，胰高血糖素和皮質醇則加速蛋白質分解。甲狀腺激素調控整體代謝速率，生長激素刺激肌肉蛋白質沉積。當腎功能受損時，尿素排泄障礙會導致血氨升高；肝功能異常則影響氨基酸代謝和血漿蛋白合成，可能出現水腫或凝血功能障礙。
保持蛋白質代謝平衡需均衡攝入優質蛋白如雞蛋、魚肉、豆類，避免長期過量或不足。運動可促進肌肉蛋白質合成，但劇烈運動后應及時補充氨基酸。慢性肝腎疾病患者應遵醫囑調整蛋白質攝入量，定期監測血氨和尿素氮水平。出現不明原因水腫、乏力或體重下降時，建議就醫檢查蛋白質代謝相關指標。
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